MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Veillonella parvula DSM 2008 chromosome

Total Repeats: 37700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013520	ATA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269797070
2	NC_013520	AT	3	6	282	287	50 %	50 %	0 %	0 %	269797070
3	NC_013520	CGTCA	2	10	340	349	20 %	20 %	20 %	40 %	269797070
4	NC_013520	TC	3	6	365	370	0 %	50 %	0 %	50 %	269797070
5	NC_013520	A	6	6	412	417	100 %	0 %	0 %	0 %	269797070
6	NC_013520	CAG	2	6	428	433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269797070
7	NC_013520	AG	3	6	517	522	50 %	0 %	50 %	0 %	269797070
8	NC_013520	TGA	2	6	541	546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797070
9	NC_013520	ACC	2	6	589	594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269797070
10	NC_013520	TAG	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797070
11	NC_013520	TCA	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797070
12	NC_013520	AC	3	6	630	635	50 %	0 %	0 %	50 %	269797070
13	NC_013520	CG	3	6	665	670	0 %	0 %	50 %	50 %	269797070
14	NC_013520	GCT	2	6	848	853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269797070
15	NC_013520	GGC	2	6	875	880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269797070
16	NC_013520	AC	3	6	926	931	50 %	0 %	0 %	50 %	269797070
17	NC_013520	ATGC	2	8	935	942	25 %	25 %	25 %	25 %	269797070
18	NC_013520	ATC	2	6	966	971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797070
19	NC_013520	TCG	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269797070
20	NC_013520	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797070
21	NC_013520	AAC	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269797070
22	NC_013520	ATT	2	6	1346	1351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797070
23	NC_013520	CA	3	6	1514	1519	50 %	0 %	0 %	50 %	269797070
24	NC_013520	A	6	6	1582	1587	100 %	0 %	0 %	0 %	269797070
25	NC_013520	A	7	7	1604	1610	100 %	0 %	0 %	0 %	269797070
26	NC_013520	GCA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269797070
27	NC_013520	TC	3	6	1701	1706	0 %	50 %	0 %	50 %	269797070
28	NC_013520	A	7	7	1758	1764	100 %	0 %	0 %	0 %	269797070
29	NC_013520	GAA	2	6	1766	1771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797070
30	NC_013520	AAC	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269797070
31	NC_013520	A	6	6	2339	2344	100 %	0 %	0 %	0 %	269797071
32	NC_013520	TAG	3	9	2428	2436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797071
33	NC_013520	AATT	2	8	2455	2462	50 %	50 %	0 %	0 %	269797071
34	NC_013520	AGA	2	6	2501	2506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797071
35	NC_013520	TTACA	2	10	2554	2563	40 %	40 %	0 %	20 %	269797071
36	NC_013520	GAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797071
37	NC_013520	GCA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269797071
38	NC_013520	TGA	2	6	2672	2677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797071
39	NC_013520	CTT	2	6	2703	2708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269797071
40	NC_013520	AC	3	6	2748	2753	50 %	0 %	0 %	50 %	269797071
41	NC_013520	A	7	7	2766	2772	100 %	0 %	0 %	0 %	269797071
42	NC_013520	ACT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797071
43	NC_013520	GC	3	6	2804	2809	0 %	0 %	50 %	50 %	269797071
44	NC_013520	TTA	2	6	2847	2852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797071
45	NC_013520	CA	3	6	2894	2899	50 %	0 %	0 %	50 %	269797071
46	NC_013520	TAT	2	6	2927	2932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797071
47	NC_013520	TTCC	2	8	2977	2984	0 %	50 %	0 %	50 %	269797071
48	NC_013520	CCG	2	6	3011	3016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269797071
49	NC_013520	AGA	2	6	3146	3151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797071
50	NC_013520	CACAG	2	10	3225	3234	40 %	0 %	20 %	40 %	269797071
51	NC_013520	TGT	2	6	3272	3277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269797071
52	NC_013520	AAT	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269797071
53	NC_013520	GTA	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797071
54	NC_013520	TAAAAG	2	12	3339	3350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	269797071
55	NC_013520	CAG	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269797072
56	NC_013520	GTT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269797072
57	NC_013520	CAT	2	6	3666	3671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797072
58	NC_013520	GGT	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797072
59	NC_013520	AGG	2	6	3818	3823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269797072
60	NC_013520	ATT	2	6	3852	3857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797073
61	NC_013520	GAA	2	6	4027	4032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797073
62	NC_013520	A	6	6	4057	4062	100 %	0 %	0 %	0 %	269797073
63	NC_013520	ATT	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797073
64	NC_013520	TACT	2	8	4263	4270	25 %	50 %	0 %	25 %	269797073
65	NC_013520	ATC	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797073
66	NC_013520	GTT	2	6	4296	4301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269797073
67	NC_013520	GAA	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797073
68	NC_013520	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	269797073
69	NC_013520	TGA	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797073
70	NC_013520	AAGG	2	8	4537	4544	50 %	0 %	50 %	0 %	269797073
71	NC_013520	AGC	2	6	4563	4568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269797073
72	NC_013520	GAT	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797073
73	NC_013520	TTC	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269797073
74	NC_013520	GAT	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797073
75	NC_013520	TGA	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797073
76	NC_013520	TTA	2	6	4838	4843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797073
77	NC_013520	ATTT	2	8	4887	4894	25 %	75 %	0 %	0 %	269797073
78	NC_013520	GTA	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797074
79	NC_013520	ACG	2	6	5125	5130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269797074
80	NC_013520	ATC	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797074
81	NC_013520	CAA	2	6	5146	5151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269797074
82	NC_013520	TCA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797074
83	NC_013520	TC	3	6	5231	5236	0 %	50 %	0 %	50 %	269797074
84	NC_013520	TGA	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797074
85	NC_013520	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797074
86	NC_013520	AGA	2	6	5299	5304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797074
87	NC_013520	GAA	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797074
88	NC_013520	GCT	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269797074
89	NC_013520	AT	3	6	5399	5404	50 %	50 %	0 %	0 %	269797074
90	NC_013520	AGC	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269797074
91	NC_013520	ATC	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797074
92	NC_013520	A	6	6	5459	5464	100 %	0 %	0 %	0 %	269797074
93	NC_013520	TTA	2	6	5526	5531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797074
94	NC_013520	TA	3	6	5617	5622	50 %	50 %	0 %	0 %	269797074
95	NC_013520	TGG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797074
96	NC_013520	TCA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797074
97	NC_013520	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797074
98	NC_013520	TGA	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797074
99	NC_013520	TAA	2	6	5743	5748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269797074
100	NC_013520	CAT	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797075
101	NC_013520	TCA	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797075
102	NC_013520	AT	3	6	5952	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	269797075
103	NC_013520	TG	3	6	6007	6012	0 %	50 %	50 %	0 %	269797075
104	NC_013520	TGA	2	6	6054	6059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797075
105	NC_013520	TAA	2	6	6071	6076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269797075
106	NC_013520	GTA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797076
107	NC_013520	GAT	2	6	6378	6383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797076
108	NC_013520	TGCA	2	8	6451	6458	25 %	25 %	25 %	25 %	269797076
109	NC_013520	GGT	2	6	6459	6464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797076
110	NC_013520	CGG	2	6	6470	6475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269797076
111	NC_013520	GGC	2	6	6477	6482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269797076
112	NC_013520	TGG	2	6	6494	6499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797076
113	NC_013520	TAC	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797076
114	NC_013520	GGT	2	6	6819	6824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797076
115	NC_013520	TTTC	2	8	6829	6836	0 %	75 %	0 %	25 %	269797076
116	NC_013520	CTT	2	6	6842	6847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269797076
117	NC_013520	AAG	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797076
118	NC_013520	TTG	2	6	6957	6962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269797076
119	NC_013520	TGG	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797076
120	NC_013520	ATCT	2	8	7003	7010	25 %	50 %	0 %	25 %	269797076
121	NC_013520	TGC	2	6	7019	7024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269797076
122	NC_013520	CGTG	2	8	7103	7110	0 %	25 %	50 %	25 %	269797076
123	NC_013520	CAAA	2	8	7164	7171	75 %	0 %	0 %	25 %	269797076
124	NC_013520	GAA	2	6	7245	7250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797076
125	NC_013520	GAA	2	6	7265	7270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797076
126	NC_013520	ATC	2	6	7272	7277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797076
127	NC_013520	ATTT	2	8	7419	7426	25 %	75 %	0 %	0 %	269797076
128	NC_013520	TCG	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269797076
129	NC_013520	ATC	2	6	7638	7643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797076
130	NC_013520	TTG	2	6	7683	7688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269797076
131	NC_013520	TTC	2	6	7695	7700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269797076
132	NC_013520	ACC	2	6	7751	7756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269797076
133	NC_013520	ATCAA	2	10	7762	7771	60 %	20 %	0 %	20 %	269797076
134	NC_013520	GTAT	2	8	7790	7797	25 %	50 %	25 %	0 %	269797076
135	NC_013520	TGA	2	6	7826	7831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269797076
136	NC_013520	TAC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797076
137	NC_013520	AGA	2	6	7949	7954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269797076
138	NC_013520	TCG	2	6	8009	8014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269797076
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140	NC_013520	ATATGA	2	12	8153	8164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	269797077
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142	NC_013520	TGG	2	6	8205	8210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797077
143	NC_013520	TGG	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797077
144	NC_013520	ACT	2	6	8393	8398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269797077
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148	NC_013520	GGT	2	6	8689	8694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797077
149	NC_013520	TGG	2	6	8720	8725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269797077
150	NC_013520	ACTGA	2	10	8746	8755	40 %	20 %	20 %	20 %	269797077
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153	NC_013520	TTG	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269797077
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157	NC_013520	TAAA	2	8	9101	9108	75 %	25 %	0 %	0 %	269797077
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164	NC_013520	CAA	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269797077
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167	NC_013520	ATT	2	6	9599	9604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269797078
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